Образовательная программа «6D060722- молекулярная и клеточная биология»



страница1/11
Дата12.06.2016
Размер2.33 Mb.
ТипОбразовательная программа
  1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11
Казахский национальный университет имени аль-Фараби

УДК 575.1/.2:616-006:612.36 На правах рукописи



ИСАБЕКОВА АСЕЛЬ САНИЯРБЕКОВНА



Структурно-функциональные свойства генов и микроРНК, ответственных за возникновение рака толстой кишки

6D060700- Биология (образовательная программа «6D060722- Молекулярная и клеточная биология»)

Диссертация на соискание ученой степени

доктора философии (PhD)



Научные консультанты:


доктор биологических наук,

профессор Иващенко А.Т.;

Professor, PhD Regnier M.

Республика Казахстан



Алматы, 2012

СОДЕРЖАНИЕ





ОБОЗНАЧЕНИЯ И СОКРАШЕНИЯ


4

ВВЕДЕНИЕ


5

1

ОБЗОР ЛИТЕРАТУРЫ

10

1.1

Рак толстой кишки и его генезис

10

1.1.1

Рак толстой кишки социально значимое заболевание

10

1.1.2

Генезис рака толстой кишки

10

1.1.3

Наследственные синдромы

11

1.1.4

Цитогенетика рака толстой кишки (микросателлитные и хромосомные нестабильности)

14

1.1.5

Эпигенетика и рак толстой кишки

15

1.1.6

Модификация гистонов при раке толстой кишки

16

1.1.7

Геномный импринтинг при раке толстой кишки

17

1.1.8

Генетический полиморфизм и риск развития рака толстой кишки

17

1.1.9

Раковые стволовые клетки

19

1.1.10

Стадии рака толстой кишки

21

1.1.11

Ключевые пути развития рака толстой кишки

23

1.1.12

Методы диагностики рака толстой кишки

26

1.2

МикроРНК и их роль при раке толстой кишки

28

1.2.1

Обнаружение микроРНК

28

1.2.2

Общая информация о микроРНК

29

1.2.3

Биогенез микроРНК

29

1.2.4

Регуляция экспрессии с помощью микроРНК

33

1.2.5

Предсказывание генов мишеней микроРНК

34

1.2.6

Г:У пары и неспаренные нуклеотиды в сайтах взаимодействия микроРНК

38

1.2.7

Методы верификации сайтов связывания микроРНК

39

1.2.8

Роль микроРНК в онкогенезе

40

2

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

45

2.1

Объекты исследования

45

2.2

Классификации генов

45

2.3

Поиск сайтов взаимодействия микроРНК с мРНК и описания их характеристик

45

2.4

Методика изучения различий между сайтами, предсказанными с помощью программ RNAhybrid и TargetScan

47

2.5

Методика изучения различий между сайтами, предсказанными с помощью программ RNAhybrid и miRanda

48

2.6

Изучение филогенетической консервативности сайтов предсказанных RNAhybrid

48


3


РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЯ

50


3.1

Характеристики генов ассоциированных с развитием РТК

50

3.2

Характеристики межгенных микроРНК

55

3.3

Взаимодействие межгенных микроРНК с мРНК генов, участвующих в онкогенезе

60

3.4

Характеристика взаимодействия микроРНК с генами мишенями

68

3.5

Изучение различий между сайтами, предсказанных с помощью программ RNAhybrid и TargetScan

71

3.6

Изучение различий между сайтами, предсказанных с помощью программ RNAhybrid и miRanda

76

3.7

Изучение филогенетической консервативности сайтов предсказанных RNAhybrid

80



ЗАКЛЮЧЕНИЕ

89


СПИСОК ИСПОЛЬЗОВАННЫХ ИСТОЧНИКОВ

91

ПРИЛОЖЕНИЕ А

115





Поделитесь с Вашими друзьями:
  1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11


База данных защищена авторским правом ©uverenniy.ru 2019
обратиться к администрации

    Главная страница